为正科级，承担领导小组的日常事务，翁源县农业农村局设下列内设机构：（一）办公室（电话：0751-2872338），（二）法规与改革股（电话：0751-2829950），（三）发展规划股（计划财务股）（电话：0751-2861336），（四）乡村建设和农村社会事业促进股（电话：0751-2873112），（五）乡村产业发展与农村合作经济指导股（电话：0751-2872720），（六）帮扶股（革命老区工作办公室）（电话：0751-2861336），（七）种植业管理与市场信息化股（电话：0751-2872597），（八）农产品质量安全监管股（电话：0751-2862368），（九）农田建设管理股（电话：0751-2872586），（十）科技教育和种业管理股（农业转基因生物安全管理办公室）（电话：0751-2875548），（十一）执法股（畜牧饲料兽医屠宰渔业与农机管理股）（电话：0751-2875706），（十二）人事股（电话：0751-2878616），（十三）机关党委（电话：0751-2865378）。